La Fundació Cruyff té un patronat el qual segueix el dia a dia de l'activitat de la fundació, aprova el pressupost anual, els comptes anuals i l'informe anual. A més, en cas de necessitat, se li consulta sobre decisions fonamentals.
Presidenta: Susila Cruyff
Secretari: Xavier Arbós
Membres del patronat:
• Pep Guardiola
• Xavi Hernández
• Carles Puyol
• Fernando Belasteguín
• Joan Laporta
• Jaume Roures
• Joan Francesc Pont
• Ramón Agenjo